试管婴儿是一个极其复杂的过程，如果其中一个步骤出现问题，都可以导致结果的失败，常见台湾试管婴儿失败的原因有：
1、对刺激促排卵药物不起反应，或反应很差，以至卵巢不能产生足够数量的成熟卵子。
由于患者盆腔解剖上的特殊原因而造成取卵困难甚至取不到卵子。

2、有20%的卵子由于本身原因或精子过少过弱而不能受精。

3、有20%的受精卵子不能正常发育或发生退行性变，以致不能种植回子宫腔内。尽管胚胎以植入子宫腔，但不能种植，不能妊娠，这种情况占80%。

4、其他因素影响试管婴儿的成功率：促排卵方案的制定、促进排卵药物、实验室质量控制、胚胎培养基类型、技术操作熟练程度、材料的质量、仪器的稳定性等多种因素。
此外，现实生活中还有多种其他因素影响台湾试管婴儿的成功率，试管婴儿过程注意什么，吃什么食物对身体好，什么东西一定吃不得等等细节方面。

年龄
在生育的这个问题上，女方年龄起着至关重要的作用。一般来说，男方即使五六十岁，对生育能力的影响都并不明显，可相对于女方来说就不行了。随着女方年龄的增长，生育能力会逐渐下降，35岁后下降明显加快，到了绝经期后就完全丧失，而且这一过程不可逆转。目前尚无药物可以使女人的生育能力“返老还童”。
子宫功能
子宫内膜受到严重损伤的患者，若子宫内膜厚度少于7毫米，则进行试管婴儿时妊娠率低、流产率高，目前没有方法治疗。此外，子宫畸形虽不影响试管婴儿的妊娠率，但流产率及早产率高，活胎分娩率低，因此在进行试管婴儿前最好能进行矫正手术，这样才能改善妊娠预后，提高试管婴儿妊娠率。
卵巢功能
卵巢功能是指卵巢对促排卵药物的反应性。卵巢功能越差，得到的卵子越少、卵子的质量越差，妊娠率就越低、流产率也就越高。卵巢功能除了与年龄有关以外，还与个体之间的差异有关。

此外，卵巢手术、特别是卵巢囊肿剥除术、卵巢电凝术，可严重破坏卵巢结构，损坏卵巢的功能。所以未孕青年妇女应尽可能避免卵巢囊肿剥除术，实在必须进行的应尽可能多保留卵巢组织，应避免进行卵巢切除。
输卵管积水
输卵管积水也是不孕症的一个重要原因，同时输卵管积水患者若希望怀一个试管婴儿，其妊娠率也低于无积水者，且流产率及宫外孕发生率会大大增加。

因此，此类患者在采用试管婴儿技术之前，应先请妇产科医生实施切除或近端结扎积水的输卵管手术，这样才能提高试管婴儿的妊娠率。
技术因素
包括促排卵方案、促进排卵药物、实验室质量控制、胚胎培养基类型、技术操作熟练程度、材料的质量、仪器的稳定性等多种因素。

一个有针对性的、科学的促排卵方案是至关重要的，这是成功的基础，同时使用促排卵药物也有学问，不一定非得要进口促排卵药物效果才好，关键是要适合中国妇女的特点。

此外，除了上述几点外，还有一些社会学方面的因素，对台湾试管婴儿的妊娠率有一定的影响，如：患者本身的心理因素、患者所处的社会环境等等。